Qu'est ce que la P. Namnetense ?
Indice 1 : ce terme est dérivé du nom latin de Nantes (Namnetum),
Indice 2 : pas plus grande qu'un millimètre, la P. Namnetense s'observe au microscope et est une découverte fortuite de l'équipe de bactériologie du CHU de Nantes en juin 2013,
Indice 3 : c'est un organisme vivant à structure très simple, dépourvu de noyau...
***
Réponse : une nouvelle espèce de bactéries baptisées Nantes !
L'équipe de recherche du Dr Stéphane Corvec, a découvert une nouvelle bactérie, officiellement baptisée en
référence au nom de la ville où on l’a identifiée.
Comme beaucoup de découvertes, celle de l’équipe dont fait partie le Dr
Stéphane Corvec doit une part au hasard, ainsi que l’explique le
bactériologiste : " Sachant que je travaillais sur une bactérie
proche, Propionibacterium acnes, l’une de mes collègues m’a confié une
souche qu’elle venait d’identifier chez un patient souffrant d’une
infection osseuse, notre domaine de spécialité. Au fil des tests
complémentaires effectués, il est apparu qu’il ne s’agissait pas de
l’espèce en question, notamment parce qu’on ne parvenait pas à
caractériser sa résistance à la rifampicine."
Sa curiosité piquée, le Dr Corvec entreprend des investigations qui
l’amènent progressivement à déterminer qu’il vient de découvrir une
nouvelle espèce : "L’identification biochimique et phénotypique a révélé un profil proche mais différent de P. acnes."
En poussant plus loin l’investigation, notamment par l’étude des acides gras de la paroi de la bactérie, en collaboration avec l’équipe du Pr Paul Lawson (université d’Oklahoma), l’équipe nantaise lève le doute : il s’agit bien d’une de ces bactéries présentes sur la peau, dont de nombreuses espèces sont courantes, alors que d’autres ne sont pas encore identifiées : "Elles ne sont pas dangereuses, sauf quand elles s’introduisent dans l’organisme au cours d’une intervention, en présence de matériel étranger, par exemple.
En poussant plus loin l’investigation, notamment par l’étude des acides gras de la paroi de la bactérie, en collaboration avec l’équipe du Pr Paul Lawson (université d’Oklahoma), l’équipe nantaise lève le doute : il s’agit bien d’une de ces bactéries présentes sur la peau, dont de nombreuses espèces sont courantes, alors que d’autres ne sont pas encore identifiées : "Elles ne sont pas dangereuses, sauf quand elles s’introduisent dans l’organisme au cours d’une intervention, en présence de matériel étranger, par exemple.
Une étude génétique et génomique
Devant les difficultés rencontrées pour faire reconnaître la découverte par le milieu scientifique, le Dr Corvec a procédé à une étude génétique et génomique avec séquençage du génome entier de la "bestiole", qui a confirmé sans plus de contestation possible qu’il s’agit bel et bien d’une espèce jusqu’alors inconnue. Restait à la baptiser: " Je tenais à ce que son nom évoque la ville où a eu lieu la découverte. Nous avons donc choisi de la nommer Propionibacterium namnetense, clin d’œil au nom latin de Nantes, Namnetum. "
Commentaires